Seminario

Phylogenetics from an algebraic perspective

Seminario periodico del Dipartimento di Matematica
22 novembre 2022
Orario di inizio 
11:30
PovoZero - Via Sommarive 14, Povo (Trento)
Aula seminari "-1" (Povo 0)
Organizzato da: 
Dipartimento di Matematica
Destinatari: 
Comunità universitaria
Comunità studentesca UniTrento
Partecipazione: 
Online
Email per prenotazione: 
Referente: 
Elisa Postinghel, Andrea Pinamonti
Contatti: 
Università degli Studi Trento 38123 Povo (TN) - Staff Dipartimento di Matematica
+39 04 61/281508-1625-1701-3786-1980
Speaker: 
Marta Casanellas (Universitat Politècnica de Catalunya Barcellona - Spagna)

Abstract:  In the last years there has been an increase in the use of algebraic tools in phylogenetic reconstruction. As a Markov process of substitution of nucleotides along a phylogenetic tree can be viewed as a polynomial map, it is natural to use tools from algebraic geometry and computational algebra in this setting. We will explain how these tools are used in phylogenetics and we will introduce the use of semi-algebraic constraints, which mirror the probabilistic nature of the parameters used. We will show advantages and disadvantages of the use of these algebraic methods using real and simulated data.

Eventi passati

È possibile visionare gli eventi del ciclo 2019/2020 alla pagina dedicata e del ciclo 2020/2021 alla pagina dedicata